Propriété des descendants de la famille Eynard jusqu’en 1891, le Palais Eynard fut acheté par la ville de Genève afin d’en faire un musée des beaux-arts et agrandir le jardin des Bastions jusqu’à la rue Saint-Léger.

De 1981 à 1986, il fut restauré par l’architecte F. Bouvier afin de l’affecter en Hôtel Municipal, rôle jusqu’ici réservé à l’ancien immeuble Butini-de la Rive, sis au 4 de la rue de l’Hôtel-de-Ville.

C’est en 1985 que les secrétariats des Conseils administratif et municipal y furent aménagés ainsi que les archives municipales y sont conservées.

Le Conseil administratifs y tient chaque mercredi ses séances hebdomadaires.